Сезон состоит из 42 эпизодов, которые разделены на 8 серий. Некоторые эпизоды по прежнему считаются утерянными из-за политики BBC по стиранию старых программ ради повторного использования плёнки: утеряны все эпизоды «Марко Поло» и два эпизода из «Господство террора». Тем не менее, каждый из них можно посмотреть в виде реконструкций, которые создавались при помощи сохранённых аудиодорожек и фотографий, а также официальной анимации, которую выпустили к эпизодам «Господства террора».
В первой серии впервые были представлены основные элементы «Доктора Кто»: сам Доктор и его ТАРДИС. На данный момент зрители немногое узнают о том, кто такой Доктор: из его речи в конце первого эпизода становится понятно, что они вместе с его внучкой Сьюзан являются «изгнанниками» с их родного мира, которые не так давно остановились в Англии 1960-х. Учителя Сьюзан, Барбара Райт и Йен Честертон, становятся первыми человеческими спутниками Доктора по случайности: проследив за Сьюзан до свалки, где та скрылась в полицейской будке, они врываются внутрь против воли Доктора, и тот решает похитить их из родного времени, сделав вынужденными попутчиками, так как он не может правильно управлять ТАРДИС и вернуть их в 1963 год.
Так как Доктор не умеет управлять ТАРДИС, каждое новое место и время, куда заносит машину времени, становится для путешественников во времени сюрпризом. Такая структура историй сохранится вплоть до закрытия сериала в 1989 году, с периодическими исключениями.
В 1 сезоне сериал старался сохранить баланс между историческими и научно-фантастическими историями, которые чередуются.
23 ноября - 14 декабря 1963 Первое появление Доктора, Сьюзан, Йена, Барбары, ТАРДИС и школы Коал-Хилл. Первый эпизод происходит в Лондоне 1963 года, а остальные три объединяет сюжет о пещерных людях и создании огня.
21 декабря 1963 - 1 февраля 1964 Первое появление далеков и талов, а также первая встреча Доктора с ними. Сюжет происходит на их родной планете Скаро, поражённой радиацией после Тысячелетней войны.
22 февраля - 4 апреля 1964 Все эпизоды утеряны. Первый сюжет, развивающийся вокруг исторической фигуры - Марко Поло. Историческая серия, действие которой происходит в Китае XIII века.
23 мая - 13 июня 1964 Историческая серия, действие которой развивается в империи ацтеков до прибытия европейцев. Здесь впервые представлена концепция изменения истории.
Основная идея сериала была придумана Сидни Ньюманом, главой отдела драмы BBC. В разработке формата «Доктора Кто» участвовали глава отдела сериалов Дональд Уилсон, сценарист С. Э. Уэббер и продюсер Рекс Такер, после чего руководство над сериалом было передано Верити Ламберт, первой женщине-продюсеру BBC, и Дэвиду Уитакеру, редактору сценариев.
Съёмки начались в сентябре 1963 и длились примерно 9 месяцев в Студии Лайм Гроув и Телевизионном Центре BBC.
Показ первого эпизода 23 ноября 1963 года оказался омрачён новостью об убийстве (22 ноября) президента США Джона Кеннеди, из-за чего сериал привлёк лишь 4,4 миллиона зрителей, не слишком впечатляющая цифра для того времени. Решение заново показать эпизод на следующей неделе позволило дать сериалу больше аудитории, однако основную популярность «Доктору Кто» принесла вторая серия, где впервые появились далеки - у этой серии рейтинги превысили 10 миллионов зрителей, что позволило сериалу получить продолжение.